47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0302 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0302  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 431 aa  879    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.019197  normal  0.0220531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 1496 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.83 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  23.68 
 
 		 522 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  24.4 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.14 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.01 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  21.59 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  21.5 
 
 		 491 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  28.48 
 
 		 472 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 496 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  26.24 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  20.86 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  20.17 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.07 
 
 		 491 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.09 
 
 		 465 aa  43.1  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>