More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3542 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 477 aa  961    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  59.91 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  48.21 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.15 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.92 
 
 		 464 aa  272  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.64 
 
 		 489 aa  253  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.77 
 
 		 518 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.68 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37 
 
 		 480 aa  246  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.05 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.67 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.86 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.24 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.53 
 
 		 522 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.7 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  34.23 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.98 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.38 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.31 
 
 		 488 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.48 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  34.55 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.2 
 
 		 497 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.36 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.45 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  34.82 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.08 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  35.22 
 
 		 456 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  34.69 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.84 
 
 		 497 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.95 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.94 
 
 		 497 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.56 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.93 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  33.97 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.75 
 
 		 485 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.32 
 
 		 472 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.11 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.18 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.27 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  32.82 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.03 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.26 
 
 		 473 aa  170  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.51 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  30.73 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.18 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  30 
 
 		 562 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.33 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  32.88 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.18 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.09 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.98 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  28.14 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  28.27 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.61 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.84 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  30.88 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.12 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.39 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.51 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  22.75 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.27 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.7 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.84 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.71 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.33 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.58 
 
 		 501 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  27.11 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.33 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.53 
 
 		 442 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.94 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.76 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.36 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.83 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.64 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.06 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.46 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  23.36 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.6 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.17 
 
 		 469 aa  86.7  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.12 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.45 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.34 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.89 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  26.19 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.19 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.12 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.32 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  26.19 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  26.19 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  26.23 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.25 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.88 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.2 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.01 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23.83 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>