More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2322 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 587 aa  1182    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  48.05 
 
 		 418 aa  332  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  44.61 
 
 		 415 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  44.61 
 
 		 415 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  44.61 
 
 		 415 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  43.88 
 
 		 417 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  47.63 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  45.86 
 
 		 415 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  36.48 
 
 		 409 aa  220  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  43.71 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  34.92 
 
 		 434 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  34.55 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 342 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  36.03 
 
 		 372 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  30.2 
 
 		 536 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 385 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  31.01 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 395 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.43 
 
 		 401 aa  133  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  30.24 
 
 		 396 aa  130  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 401 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  31.04 
 
 		 390 aa  127  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 456 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  28.24 
 
 		 456 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 		 335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  27.73 
 
 		 393 aa  118  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  30.89 
 
 		 376 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 387 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 368 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  30.59 
 
 		 422 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  28.31 
 
 		 397 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 413 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  28.91 
 
 		 401 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 		 382 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  26.7 
 
 		 363 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  27.84 
 
 		 368 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  30.22 
 
 		 320 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  30.47 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  29.92 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  43.31 
 
 		 364 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  43.31 
 
 		 350 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  24.59 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  27.53 
 
 		 412 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  26.32 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  25.46 
 
 		 338 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.52 
 
 		 339 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  27.34 
 
 		 691 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  23.86 
 
 		 356 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  27.53 
 
 		 405 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  34.39 
 
 		 357 aa  97.8  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 		 282 aa  97.8  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  35.96 
 
 		 324 aa  97.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  27.17 
 
 		 588 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  36.16 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  35.59 
 
 		 347 aa  96.3  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  24.8 
 
 		 356 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.99 
 
 		 333 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  33 
 
 		 384 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  32.78 
 
 		 385 aa  95.1  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  27.54 
 
 		 370 aa  95.1  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  32.56 
 
 		 314 aa  95.1  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  24.44 
 
 		 356 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  35.48 
 
 		 343 aa  94.7  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  35.98 
 
 		 599 aa  93.6  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  26.38 
 
 		 658 aa  94  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  33.64 
 
 		 357 aa  93.6  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  24.08 
 
 		 337 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  31.25 
 
 		 336 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  23.88 
 
 		 356 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  26.72 
 
 		 407 aa  92.8  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  34.48 
 
 		 393 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  35.71 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  42.19 
 
 		 343 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  23.51 
 
 		 356 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  35.08 
 
 		 456 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 		 312 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  34.48 
 
 		 392 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  24.92 
 
 		 335 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  25.27 
 
 		 338 aa  92  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  34.18 
 
 		 579 aa  92  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  33.15 
 
 		 332 aa  92  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  27.19 
 
 		 332 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  26.89 
 
 		 332 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  27.92 
 
 		 415 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  31.37 
 
 		 336 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  31.37 
 
 		 336 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 336 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  33 
 
 		 384 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.6 
 
 		 356 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 392 aa  90.9  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  30.18 
 
 		 338 aa  90.9  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 342 aa  90.1  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  25.77 
 
 		 416 aa  90.5  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  23.66 
 
 		 351 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  40.14 
 
 		 334 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  31.17 
 
 		 337 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 357 aa  90.1  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.39 
 
 		 343 aa  90.1  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>