More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3148 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  96.98 
 
 		 204 aa  352  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  58.85 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  59.38 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  61.83 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  57.92 
 
 		 196 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  57.87 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.12 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  56.25 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  55.56 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  57.07 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  56.83 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  56.28 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  55.74 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  52.11 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.41 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  56.28 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  56.28 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  50 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  38.8 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.36 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  41.32 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  41.32 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  41.07 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  34.05 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  40.72 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  35.33 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  35.86 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  34.87 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  34.36 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  34.13 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  36.21 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  38.46 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  32.53 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.27 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  46.32 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  39.58 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.34 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.67 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.26 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  39.13 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  42.22 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0085  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  hitchhiker  0.00000571122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  38.66 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.64 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.16 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  38.66 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.07 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  31.38 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1887  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  29.12 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.71 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  30.16 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  41.86 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.48 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  41.41 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  36.72 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.5 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  29.21 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  31.31 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  40.43 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  31.58 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  29.94 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  36.08 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  32.12 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0983  P-Ser-HPr phosphatase  27.88 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>