297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2901 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 420 aa  859    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  36.6 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.13 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  36.18 
 
 		 423 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  35.66 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  36.13 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  34.11 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  34.35 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  34.11 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  34.35 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  34.35 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  34.35 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  34.35 
 
 		 430 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  34.35 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  34.35 
 
 		 430 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  32.37 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  33.56 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.96 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  36.05 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  32.17 
 
 		 503 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  32.47 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  36.03 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  33.91 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  31.03 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  34.04 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  31.72 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  32.1 
 
 		 688 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 793 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  31.25 
 
 		 647 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.24 
 
 		 1115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  30.08 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.84 
 
 		 1115 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  30.11 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.56 
 
 		 1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.56 
 
 		 1115 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.84 
 
 		 1119 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  28.99 
 
 		 579 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  31.65 
 
 		 444 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 567 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  28.41 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 1124 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.19 
 
 		 927 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 1154 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 356 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 1101 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  26.62 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  25.35 
 
 		 521 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 1118 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  29.9 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  39.62 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  44.21 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  45.56 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  29.81 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  45.65 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  51.95 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  43.48 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  33.01 
 
 		 179 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  24.05 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  36.89 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  23.64 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  41.05 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 		 142 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  26.88 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  33.65 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  22.65 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  32.71 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  32.71 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  37.11 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.97 
 
 		 289 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  31.68 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  35.19 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.1 
 
 		 620 aa  56.2  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 539 aa  56.2  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  32.73 
 
 		 587 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  31.78 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>