116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6293 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  100 
 
 		 385 aa  772    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  34.09 
 
 		 479 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  34.09 
 
 		 479 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  32.56 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  29.12 
 
 		 488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  28.5 
 
 		 412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  31.61 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.21 
 
 		 465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  32.23 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  30.13 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  29.85 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  28.5 
 
 		 467 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  27.61 
 
 		 460 aa  109  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  36.19 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  26.46 
 
 		 501 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  27.63 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  27.81 
 
 		 484 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  27.7 
 
 		 469 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  27.7 
 
 		 469 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  27.7 
 
 		 469 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  26.34 
 
 		 522 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  25.83 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.22 
 
 		 529 aa  89.4  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  26.46 
 
 		 500 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  26.78 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  27.64 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  25.88 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.16 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.88 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.88 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.04 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.89 
 
 		 539 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  24.58 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.53 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0849  DNA recombinase, putative  22.15 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  24.43 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0853  DNA recombinase, putative  21.85 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000111674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.23 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  20.99 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.21 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.88 
 
 		 613 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  23.65 
 
 		 506 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  30.64 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.85 
 
 		 475 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  26.15 
 
 		 622 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.63 
 
 		 510 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  27.64 
 
 		 564 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.1 
 
 		 445 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.75 
 
 		 474 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  27.73 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.67 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.27 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  21.11 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  23.92 
 
 		 558 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.53 
 
 		 527 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.15 
 
 		 525 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  26.87 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  21.65 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  28.32 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.08 
 
 		 528 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.08 
 
 		 528 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2108  hypothetical protein  25.47 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0876721  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 500 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  27.38 
 
 		 590 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.27 
 
 		 523 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.89 
 
 		 511 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4164  hypothetical protein  24.54 
 
 		 501 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  22.27 
 
 		 552 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.38 
 
 		 523 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  20.44 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  25.81 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 		 548 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.57 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.27 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.03 
 
 		 540 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.79 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  25.47 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.47 
 
 		 569 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  23.98 
 
 		 500 aa  47.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  27.45 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  18.99 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  23.35 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  23 
 
 		 523 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  27.12 
 
 		 532 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.83 
 
 		 665 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  29.66 
 
 		 549 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  27.5 
 
 		 550 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.32 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.1 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  21.91 
 
 		 546 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.58 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.48 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  20.37 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>