82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4978 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 403 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  40.4 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  42.39 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  39.49 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  31.45 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 410 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  35.04 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  35.03 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  32.25 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  39.35 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  27.42 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  34.66 
 
 		 419 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.06 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  31.34 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  29.66 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  34.59 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  32.65 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  31.64 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.88 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.25 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  28.15 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  27.53 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  25.12 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  36.75 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>