More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4887 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  100 
 
 		 455 aa  907    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  65.84 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  74.26 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  71.43 
 
 		 266 aa  352  7e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  70.25 
 
 		 262 aa  348  9e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  71.19 
 
 		 255 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  70.59 
 
 		 247 aa  342  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  69.49 
 
 		 255 aa  340  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  69.26 
 
 		 256 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  67.61 
 
 		 277 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  68.49 
 
 		 256 aa  336  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.2 
 
 		 253 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  67.09 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  65.7 
 
 		 250 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  69.03 
 
 		 253 aa  327  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  66.11 
 
 		 277 aa  323  5e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  72.12 
 
 		 257 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  66.53 
 
 		 255 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  67.25 
 
 		 261 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  66.81 
 
 		 258 aa  316  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  65.55 
 
 		 258 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  61.35 
 
 		 258 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  64.26 
 
 		 259 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  67.1 
 
 		 252 aa  309  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  65.65 
 
 		 264 aa  309  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  64.35 
 
 		 268 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  62.13 
 
 		 263 aa  307  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  62.4 
 
 		 258 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  61.92 
 
 		 271 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  65.13 
 
 		 247 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.57 
 
 		 274 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  64.5 
 
 		 255 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  68.51 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  68.2 
 
 		 258 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.64 
 
 		 280 aa  294  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  62.14 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  63.84 
 
 		 244 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  63.71 
 
 		 257 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  60.08 
 
 		 279 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 243 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  65.57 
 
 		 250 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 279 aa  281  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  58.62 
 
 		 266 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  63.87 
 
 		 255 aa  279  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  63.32 
 
 		 302 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.45 
 
 		 252 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.77 
 
 		 256 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  54.2 
 
 		 253 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.93 
 
 		 245 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 271 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.91 
 
 		 269 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.31 
 
 		 243 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  59.41 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.73 
 
 		 293 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  60.57 
 
 		 249 aa  252  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.7 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  54.78 
 
 		 244 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  56.83 
 
 		 272 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.58 
 
 		 241 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 255 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 249 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.68 
 
 		 248 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  59.9 
 
 		 224 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  53.16 
 
 		 247 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  52.47 
 
 		 240 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.98 
 
 		 230 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.24 
 
 		 269 aa  223  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 252 aa  223  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.54 
 
 		 228 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.26 
 
 		 240 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 249 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  48.4 
 
 		 225 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.4 
 
 		 279 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.58 
 
 		 230 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.5 
 
 		 229 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.62 
 
 		 241 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 227 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  46.82 
 
 		 244 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.98 
 
 		 225 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  47.71 
 
 		 249 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.06 
 
 		 266 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.98 
 
 		 226 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 229 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  43.61 
 
 		 256 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.03 
 
 		 237 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.12 
 
 		 233 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.3 
 
 		 242 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.37 
 
 		 225 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 246 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.51 
 
 		 225 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.77 
 
 		 251 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.83 
 
 		 242 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 221 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 229 aa  206  7e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  49.3 
 
 		 565 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.77 
 
 		 248 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  48.68 
 
 		 256 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>