More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3803 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 
378 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  45.69 
 
 
372 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  41.47 
 
 
378 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  39.44 
 
 
391 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  39.95 
 
 
394 aa  272  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  41.27 
 
 
376 aa  269  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  41.29 
 
 
394 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  41.77 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  43.48 
 
 
398 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  40.51 
 
 
382 aa  262  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  40.76 
 
 
388 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  43.71 
 
 
398 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  40.67 
 
 
383 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  36.83 
 
 
389 aa  252  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  38.01 
 
 
383 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  36.55 
 
 
396 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  38.5 
 
 
385 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  41.27 
 
 
394 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  38.64 
 
 
375 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  37.91 
 
 
390 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  40.99 
 
 
373 aa  239  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  38.69 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  37.69 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  37.82 
 
 
386 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  40.06 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  38.38 
 
 
383 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  38.01 
 
 
384 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  42.31 
 
 
413 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  38.46 
 
 
375 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  36.57 
 
 
397 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  43.94 
 
 
396 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  37.19 
 
 
386 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  36.25 
 
 
389 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  35.51 
 
 
408 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  38.19 
 
 
385 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  37.77 
 
 
390 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 
430 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  36.25 
 
 
397 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  35.88 
 
 
377 aa  225  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  33.25 
 
 
405 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  45.29 
 
 
378 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  42.22 
 
 
392 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  36.63 
 
 
408 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  37.18 
 
 
354 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  34.68 
 
 
382 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  36.3 
 
 
402 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  38.96 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  41 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  42.12 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  37.7 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  37.38 
 
 
394 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  34.29 
 
 
371 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  37.69 
 
 
367 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  35.34 
 
 
381 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  47.56 
 
 
273 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  36.5 
 
 
385 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 
378 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  32.75 
 
 
390 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  40.76 
 
 
408 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  33.16 
 
 
379 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  34.83 
 
 
424 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 
386 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  34.9 
 
 
382 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  38.59 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  32.35 
 
 
383 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  37.32 
 
 
384 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  29.35 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  36.55 
 
 
374 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  36.7 
 
 
381 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  37.5 
 
 
407 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  29.73 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  29.81 
 
 
379 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  31.06 
 
 
411 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  34.1 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 
383 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  32.44 
 
 
376 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  35.65 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  35.86 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  36.54 
 
 
337 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 
332 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  32.5 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  32.11 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3097  FecR protein  36.1 
 
 
344 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  0.330772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 
365 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3204  anti-FecI sigma factor, FecR  28 
 
 
371 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.619399  normal  0.25037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  37.43 
 
 
380 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  29.83 
 
 
326 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  35.27 
 
 
329 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 
308 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 
313 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 
323 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  35.16 
 
 
337 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 
335 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  28.85 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  31.47 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>