191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0602 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  100 
 
 
2491 aa  5076    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0603  PKD domain-containing protein  33.43 
 
 
927 aa  309  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  33.95 
 
 
716 aa  211  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  32.49 
 
 
685 aa  197  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  36.76 
 
 
1012 aa  191  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  39.15 
 
 
1041 aa  186  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  34.63 
 
 
587 aa  185  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  32.66 
 
 
1290 aa  185  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  39.35 
 
 
526 aa  175  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  33.79 
 
 
601 aa  169  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  33.23 
 
 
1017 aa  161  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  34.88 
 
 
304 aa  157  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  28.64 
 
 
640 aa  157  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  35.83 
 
 
283 aa  148  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  34.84 
 
 
899 aa  144  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  28.16 
 
 
447 aa  144  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  38.08 
 
 
304 aa  142  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  39.06 
 
 
258 aa  139  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.97 
 
 
1107 aa  139  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  35.17 
 
 
249 aa  135  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.25 
 
 
867 aa  132  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.31 
 
 
482 aa  132  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  32.13 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  37.55 
 
 
247 aa  130  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  33.86 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  38.86 
 
 
230 aa  127  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  32.03 
 
 
263 aa  127  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  32.63 
 
 
543 aa  120  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  38.1 
 
 
892 aa  120  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32 
 
 
1263 aa  118  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.55 
 
 
863 aa  118  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  36.84 
 
 
237 aa  117  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  27.46 
 
 
454 aa  117  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.82 
 
 
354 aa  115  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.34 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  34.54 
 
 
1000 aa  113  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  27.95 
 
 
454 aa  112  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  31.42 
 
 
497 aa  112  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.9 
 
 
937 aa  110  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.93 
 
 
508 aa  110  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  37.13 
 
 
937 aa  109  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.28 
 
 
1015 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.95 
 
 
1024 aa  105  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  35.38 
 
 
222 aa  105  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  26.93 
 
 
596 aa  103  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  40.8 
 
 
127 aa  102  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  36.09 
 
 
169 aa  99.4  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  25.25 
 
 
540 aa  99  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  34.3 
 
 
2324 aa  99  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  31.82 
 
 
593 aa  96.3  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  35.06 
 
 
348 aa  94.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  30 
 
 
890 aa  93.2  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  39.02 
 
 
886 aa  91.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  30.98 
 
 
1749 aa  90.9  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  32.22 
 
 
4500 aa  89  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.38 
 
 
757 aa  88.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  25.55 
 
 
633 aa  87.4  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  28.71 
 
 
461 aa  85.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.7 
 
 
476 aa  85.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  35.66 
 
 
168 aa  84  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.39 
 
 
713 aa  80.5  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  31.94 
 
 
682 aa  77.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  29.75 
 
 
768 aa  73.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  28.86 
 
 
734 aa  73.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  25.14 
 
 
1565 aa  72.8  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  36.84 
 
 
291 aa  72  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.05 
 
 
761 aa  70.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.16 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  27.11 
 
 
689 aa  69.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.46 
 
 
307 aa  68.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  25.92 
 
 
1292 aa  68.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  24.71 
 
 
648 aa  67.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  29.56 
 
 
329 aa  66.6  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2740  hypothetical protein  27.98 
 
 
668 aa  66.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1866  hypothetical protein  27.98 
 
 
668 aa  66.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  22.36 
 
 
1606 aa  65.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3178  hypothetical protein  27.11 
 
 
628 aa  65.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110039  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.52 
 
 
242 aa  64.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.26 
 
 
2272 aa  64.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46795  predicted protein  28.16 
 
 
394 aa  63.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0217893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  30.13 
 
 
497 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  28.74 
 
 
1667 aa  63.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  32.7 
 
 
296 aa  63.9  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.63 
 
 
448 aa  63.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  30.36 
 
 
821 aa  63.2  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25 
 
 
1862 aa  63.2  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.54 
 
 
467 aa  61.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  29.89 
 
 
512 aa  61.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.46 
 
 
1344 aa  60.1  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  28.42 
 
 
3295 aa  59.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 
440 aa  58.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.6 
 
 
1094 aa  58.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.61 
 
 
760 aa  58.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  21.85 
 
 
2176 aa  58.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  28.44 
 
 
347 aa  58.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  34.78 
 
 
443 aa  56.6  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  25.09 
 
 
760 aa  56.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.55 
 
 
1395 aa  56.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.1 
 
 
341 aa  56.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  28.22 
 
 
204 aa  56.2  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>