18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1866 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3178  hypothetical protein  91.47 
 
 
628 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110039  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2740  hypothetical protein  100 
 
 
668 aa  1116    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  96.71 
 
 
689 aa  951    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1866  hypothetical protein  100 
 
 
668 aa  1116    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  91.45 
 
 
497 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0908  hypothetical protein  96.32 
 
 
348 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1438  hypothetical protein  75.95 
 
 
460 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  34.23 
 
 
667 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  32.87 
 
 
828 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  38.7 
 
 
1860 aa  97.8  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  33.08 
 
 
991 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  27.03 
 
 
2764 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  32.77 
 
 
913 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  27.98 
 
 
2491 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  36.68 
 
 
941 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  21.68 
 
 
674 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1188  hypothetical protein  25.42 
 
 
635 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3197  hypothetical protein  25.86 
 
 
231 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>