More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2214 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  31.29 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.78 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  29.66 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 87 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.55 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  31.14 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  29.81 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  25.17 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.06 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.6 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.06 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.06 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>