91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4349 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  97.55 
 
 		 815 aa  1506    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 815 aa  1650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  79.48 
 
 		 809 aa  1236    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0996  hypothetical protein  88.89 
 
 		 459 aa  800    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  75.06 
 
 		 813 aa  1099    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  92.13 
 
 		 361 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  34.3 
 
 		 959 aa  369  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  31.22 
 
 		 1216 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.87 
 
 		 877 aa  258  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  31.9 
 
 		 971 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  31.16 
 
 		 971 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  49.14 
 
 		 935 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  48.57 
 
 		 935 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  27.12 
 
 		 956 aa  163  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  29.24 
 
 		 733 aa  154  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  40.54 
 
 		 1025 aa  153  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  42.94 
 
 		 1025 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  40.54 
 
 		 1025 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  26.68 
 
 		 1183 aa  147  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2882  TP901 family phage tail tape measure protein  26.46 
 
 		 1183 aa  147  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143408  normal  0.327483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  26.97 
 
 		 1183 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  28.06 
 
 		 1183 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  26.76 
 
 		 1183 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  26.43 
 
 		 1183 aa  142  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  28.49 
 
 		 1183 aa  141  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  24.69 
 
 		 2066 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  24.69 
 
 		 2066 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2103  hypothetical protein  32.99 
 
 		 737 aa  127  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  27.93 
 
 		 1549 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.19 
 
 		 1032 aa  121  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  26 
 
 		 1178 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  24.12 
 
 		 877 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  35.06 
 
 		 887 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  34.47 
 
 		 920 aa  105  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  33.33 
 
 		 919 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  29.68 
 
 		 975 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  31.61 
 
 		 986 aa  101  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  26.56 
 
 		 1297 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  33.9 
 
 		 863 aa  99.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  26.27 
 
 		 1127 aa  99.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  27.21 
 
 		 701 aa  98.2  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  31.74 
 
 		 914 aa  97.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5635  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.21 
 
 		 1371 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  25.28 
 
 		 969 aa  84.7  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.68 
 
 		 1343 aa  80.1  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.41 
 
 		 981 aa  77.8  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  34.93 
 
 		 1078 aa  76.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  33.33 
 
 		 823 aa  70.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0253  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.76 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  21.09 
 
 		 680 aa  67  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  25.47 
 
 		 1409 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  23.26 
 
 		 1346 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.57 
 
 		 1173 aa  65.5  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  23.34 
 
 		 1671 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  22.99 
 
 		 997 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4245  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.47 
 
 		 1478 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.45 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  22.8 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  22.8 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.34 
 
 		 760 aa  62.4  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.47 
 
 		 959 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  24.47 
 
 		 959 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  24.18 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  24.18 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.13 
 
 		 1211 aa  57.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  24.32 
 
 		 1211 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  23.32 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  24.87 
 
 		 757 aa  56.6  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1515  TP901 family phage tail tape measure protein  26.75 
 
 		 921 aa  55.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1041  probable tail length determinator  25.86 
 
 		 704 aa  55.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1213  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.38 
 
 		 1245 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  22.17 
 
 		 655 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05040  hypothetical protein  28.32 
 
 		 851 aa  54.7  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  23.52 
 
 		 1283 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  22.39 
 
 		 642 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  23.08 
 
 		 642 aa  51.6  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  21.33 
 
 		 1660 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  23.06 
 
 		 641 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.35 
 
 		 738 aa  49.3  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  22.22 
 
 		 656 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  22.33 
 
 		 656 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5175  TP901 family phage tail tape measure protein  27.89 
 
 		 1152 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0709  TP901 family phage tail tape measure protein  25.19 
 
 		 709 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25 
 
 		 743 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  24.03 
 
 		 684 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  26 
 
 		 759 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  24.03 
 
 		 684 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  26.24 
 
 		 1030 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  25 
 
 		 598 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.15 
 
 		 1211 aa  44.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0079  TP901 family phage tail tape measure protein  22.45 
 
 		 987 aa  44.3  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>