114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2257 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 342 aa  715    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  61.14 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  61.45 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  58.75 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  54.74 
 
 		 329 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  48.21 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  43.37 
 
 		 334 aa  272  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  45.51 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  45.21 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  42.51 
 
 		 338 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  60.64 
 
 		 200 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  60 
 
 		 147 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  34.23 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  30 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25.49 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  28.9 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.33 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  28.79 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  28.79 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  28.04 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  28.17 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  28.17 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.21 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  27.73 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  27.33 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  26.8 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.64 
 
 		 342 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  25.52 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.73 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  31.17 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  25.44 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  23.34 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  25.29 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  23.34 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  23.34 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.47 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  27.96 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.45 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  26.57 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  22.58 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  21.23 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  27.03 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  26.44 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  26.44 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  22.51 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  32.65 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  22.1 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  23.41 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  21.56 
 
 		 424 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  23.53 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  24.3 
 
 		 400 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  23.7 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.46 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  25.14 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  23.22 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.41 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  24.83 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  22.66 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  23.93 
 
 		 455 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  21.54 
 
 		 312 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  25.18 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  23.76 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  23.36 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  26.55 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  24.61 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.51 
 
 		 467 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  20.56 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  23.93 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  22.06 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  21.74 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  26.06 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.78 
 
 		 444 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  25.8 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  25.8 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  27.78 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.52 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.01 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  26.82 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.77 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  23.63 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>