More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0341 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 311 aa  643    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  77.81 
 
 		 310 aa  527  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  46.25 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  39.38 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.51 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  40.67 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.19 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.6 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.27 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.16 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.66 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.41 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.41 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.41 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.81 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.67 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  38.74 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.12 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  36.3 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.28 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.71 
 
 		 323 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.54 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.64 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  37.1 
 
 		 329 aa  208  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.31 
 
 		 329 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.05 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.05 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.48 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.88 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  36.19 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  35.81 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.14 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  35.81 
 
 		 365 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.33 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.33 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  35.2 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  35.16 
 
 		 367 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  35.81 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  36.07 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  33.33 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  33.55 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  35.28 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  35.62 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  35.05 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  35.33 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  33.67 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  33.67 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  31.89 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  32.89 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  33.8 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  34.34 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  33 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.63 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  34.22 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  31.95 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  32.12 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  33.68 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  33.68 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.97 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  33.78 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  33.68 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  34.39 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  32.13 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  32.57 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  33.1 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  33.1 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  31.13 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  32.89 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  34.55 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  33.1 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  33.1 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  31.89 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  32.7 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  34.55 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  32.89 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  32.68 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.78 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  31.88 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  33.11 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  30.54 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  33.68 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.26 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.56 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.15 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>