More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2725 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  100 
 
 		 228 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  66.82 
 
 		 227 aa  295  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  61.88 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  53.95 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  53.95 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  54.82 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  55.65 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  53.95 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  55.75 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  49.13 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  55.26 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  48.17 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  48.46 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  47.58 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  48.18 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  51.12 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  46.15 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  47.58 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  43.3 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  40.16 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  58.62 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  41.89 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  43.84 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  47.95 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  40.99 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  39.66 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  42.29 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  66.67 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  35.34 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  41.46 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  34.76 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  39.78 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  38.54 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  34.18 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  34.3 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  33.2 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.39 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  34.6 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  33.48 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  36.36 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  31.78 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  40.79 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  32.05 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.63 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.93 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.93 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.93 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.61 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  32.89 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.16 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.36 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  31.9 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  33.85 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  33.85 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  33.85 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.51 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.66 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.66 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  36.55 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  33.52 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.49 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.49 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.26 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.83 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  34.84 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  35.76 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  34.84 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  38.98 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.84 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  29.26 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  33.77 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  32.72 
 
 		 545 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  35.1 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  34.43 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  34.43 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  35.1 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  32.92 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  35.67 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.84 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.82 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  30.92 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  35.14 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  35.46 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  30.92 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  28.07 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.67 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  30.72 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>