More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0781 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  100 
 
 		 260 aa  536  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  64 
 
 		 210 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  44.2 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  33.76 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 424 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 189 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  33.93 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  46.96 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  33.73 
 
 		 189 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  41.79 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.6 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.74 
 
 		 181 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  47.11 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  47.11 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 183 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 476 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 192 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  49.17 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 196 aa  99  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  42.74 
 
 		 181 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  38.61 
 
 		 341 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 214 aa  99  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 150 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  40.5 
 
 		 193 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 165 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  37.5 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  39.67 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  38.97 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 342 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.42 
 
 		 285 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.26 
 
 		 220 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.27 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  38.35 
 
 		 194 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  45.38 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  44.26 
 
 		 342 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  35.62 
 
 		 186 aa  95.9  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  41.6 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 190 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 190 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 190 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  44.55 
 
 		 221 aa  95.9  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 342 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 203 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  45.38 
 
 		 187 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 193 aa  95.5  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  40 
 
 		 164 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  34.13 
 
 		 384 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  40 
 
 		 154 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  40 
 
 		 164 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  28.72 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.22 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 147 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 147 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  40 
 
 		 164 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  38.13 
 
 		 171 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.38 
 
 		 332 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 347 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 188 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  37.59 
 
 		 193 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  45 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 		 191 aa  92.8  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 183 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 211 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  41.38 
 
 		 152 aa  92.8  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 532 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 335 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 154 aa  92.4  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  38.24 
 
 		 205 aa  92.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 194 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>