More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2346 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2346  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 		 512 aa  1026    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.881407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.56 
 
 		 1523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.8 
 
 		 1454 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.89 
 
 		 1363 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.38 
 
 		 1364 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 		 677 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 		 1163 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1789 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.63 
 
 		 1652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 		 1481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.1 
 
 		 696 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.39 
 
 		 1510 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.57 
 
 		 947 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.38 
 
 		 1242 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.82 
 
 		 1686 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.83 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.14 
 
 		 1416 aa  107  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 505 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  29.47 
 
 		 344 aa  106  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  28.08 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1196 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24 
 
 		 657 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.75 
 
 		 676 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.85 
 
 		 1188 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1553 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1474 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.6 
 
 		 1280 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.75 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.61 
 
 		 1236 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.64 
 
 		 1557 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.84 
 
 		 930 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.53 
 
 		 698 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 1221 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.1 
 
 		 630 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1427 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.58 
 
 		 1247 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1599 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 		 1213 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 		 1240 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  27.06 
 
 		 346 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.5 
 
 		 1357 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1367 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.97 
 
 		 1193 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.2 
 
 		 1188 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 316 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1211 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.38 
 
 		 687 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.95 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.81 
 
 		 1656 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.58 
 
 		 742 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  25.89 
 
 		 317 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.45 
 
 		 1626 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.63 
 
 		 664 aa  90.9  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.29 
 
 		 1868 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.51 
 
 		 1004 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1552 aa  90.5  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.76 
 
 		 740 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.51 
 
 		 1164 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1807 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.4 
 
 		 1330 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 914 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 316 aa  86.7  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1661 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.63 
 
 		 1161 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  21.35 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.63 
 
 		 1161 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 1711 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.12 
 
 		 1262 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  24.7 
 
 		 826 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.06 
 
 		 1599 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.6 
 
 		 1484 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  30.18 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.67 
 
 		 1760 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.12 
 
 		 1609 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.98 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.41 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.44 
 
 		 1177 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.57 
 
 		 1607 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  29.84 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.33 
 
 		 608 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.18 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  23.15 
 
 		 1311 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  23.65 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.43 
 
 		 1190 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30 
 
 		 675 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  22.66 
 
 		 778 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  25.87 
 
 		 316 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.72 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.24 
 
 		 1856 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.73 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  26.37 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1176 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  22.56 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  28.76 
 
 		 1766 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.46 
 
 		 1205 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  24.41 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.84 
 
 		 1831 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>