More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1217 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 438 aa  896    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  26.17 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 		 458 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 464 aa  97.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 493 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 489 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 489 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 442 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 463 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  25.41 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.05 
 
 		 874 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.26 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.35 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.57 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.64 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.01 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  25.08 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.04 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.04 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2494  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  24.52 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  24.76 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.95 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  21.84 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  25.06 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.8 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.23 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.73 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.75 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.42 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.93 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.54 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.08 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  26.61 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.33 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  26.72 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.01 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.79 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.56 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.95 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.95 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.41 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.45 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.77 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.9 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.05 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  21.66 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  24.78 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1705  Outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.370592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.24 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.02 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>