More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4769 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  100 
 
 
581 aa  1196    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  51.12 
 
 
574 aa  617  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  47.26 
 
 
577 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  47.26 
 
 
577 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  49.74 
 
 
605 aa  555  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.67 
 
 
582 aa  485  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.71 
 
 
588 aa  482  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  42.69 
 
 
588 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.6 
 
 
574 aa  459  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.49 
 
 
577 aa  436  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  40.96 
 
 
587 aa  437  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.32 
 
 
579 aa  428  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  38.21 
 
 
579 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  38.54 
 
 
581 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.22 
 
 
577 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  35.97 
 
 
577 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  36.75 
 
 
578 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  36.75 
 
 
578 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.86 
 
 
581 aa  364  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  37.6 
 
 
579 aa  358  9.999999999999999e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.28 
 
 
585 aa  356  5.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  39.68 
 
 
577 aa  356  6.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.62 
 
 
581 aa  353  5.9999999999999994e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.99 
 
 
578 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.99 
 
 
593 aa  344  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.73 
 
 
611 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
579 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.66 
 
 
576 aa  331  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  39.32 
 
 
582 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.65 
 
 
596 aa  329  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.7 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.89 
 
 
592 aa  319  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.27 
 
 
581 aa  317  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.68 
 
 
593 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.68 
 
 
581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  36.27 
 
 
579 aa  313  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.87 
 
 
597 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.82 
 
 
607 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.02 
 
 
592 aa  309  6.999999999999999e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.74 
 
 
597 aa  309  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  33.53 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.31 
 
 
581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  32.59 
 
 
574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.27 
 
 
593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.66 
 
 
574 aa  303  6.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 
571 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.04 
 
 
572 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.56 
 
 
604 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.54 
 
 
573 aa  297  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.71 
 
 
618 aa  296  7e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.61 
 
 
577 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.71 
 
 
589 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  32.91 
 
 
618 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.9 
 
 
568 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  33.2 
 
 
583 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.82 
 
 
577 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.27 
 
 
587 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.27 
 
 
587 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.05 
 
 
596 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.58 
 
 
1228 aa  290  7e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  31.39 
 
 
581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.73 
 
 
580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.37 
 
 
602 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  34.34 
 
 
598 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.71 
 
 
580 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.27 
 
 
584 aa  283  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.37 
 
 
619 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.38 
 
 
576 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.28 
 
 
572 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.58 
 
 
603 aa  281  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  32.29 
 
 
588 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.73 
 
 
573 aa  280  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
579 aa  280  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  33.21 
 
 
606 aa  280  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  29.07 
 
 
608 aa  279  8e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.59 
 
 
595 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  32.31 
 
 
600 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
582 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  32.11 
 
 
595 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
591 aa  276  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.97 
 
 
578 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  31.12 
 
 
590 aa  276  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.5 
 
 
627 aa  276  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  33.88 
 
 
582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.72 
 
 
598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.83 
 
 
580 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.53 
 
 
580 aa  273  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.22 
 
 
627 aa  273  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.41 
 
 
583 aa  273  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.94 
 
 
596 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  30.55 
 
 
599 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.09 
 
 
598 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.14 
 
 
595 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  31.93 
 
 
595 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  31.8 
 
 
571 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  30.76 
 
 
584 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  34.22 
 
 
584 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  33.04 
 
 
597 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.86 
 
 
582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 
565 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>