More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3526 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3526  type II secretion system protein  100 
 
 		 407 aa  803    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0180062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  29.03 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  32.27 
 
 		 409 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  28.04 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.54 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  26.68 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  27.3 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.8 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  25 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  24.94 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  27.43 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  31.53 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.6 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  26.29 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 419 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  28.75 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  25.67 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  26.17 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  23.8 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  26.17 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  23.8 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  31.5 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  25.5 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  28.36 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 408 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  24.03 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  26.97 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  27.56 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  25.8 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.56 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.19 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  25.79 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  25 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  25.8 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  28.01 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 421 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  28.08 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  25.25 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  28.08 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  28.08 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  28.08 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  28.08 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  28.08 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  28.08 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  24.21 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  24.15 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  27.83 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  25.75 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  26.36 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  28.09 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  25 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  25 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  24.5 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  27.41 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  25.12 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  23.34 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  23.02 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  24.02 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  28.57 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  22.72 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  28.33 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>