More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0682 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  77.49 
 
 		 231 aa  360  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  58.52 
 
 		 234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  57.83 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  44.93 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  43.54 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  41.23 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  41.78 
 
 		 303 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  41.04 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  42.18 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.34 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.34 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.81 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  39.27 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.97 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  37.78 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  39.23 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.76 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 316 aa  161  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.67 
 
 		 312 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  40.87 
 
 		 298 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  38.25 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  41.71 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.14 
 
 		 328 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.81 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.5 
 
 		 332 aa  158  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  38.24 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  38.01 
 
 		 340 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.07 
 
 		 319 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  40.58 
 
 		 318 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  38.21 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  39.23 
 
 		 331 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.57 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 		 317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 747 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.91 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  37.74 
 
 		 300 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  36.7 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.76 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 332 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.35 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 309 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  40 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 		 321 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 304 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  36.32 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  38.94 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 312 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  38.03 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0916  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0694258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  36.62 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.98 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  37.77 
 
 		 307 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.75 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 		 356 aa  151  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  40.19 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 305 aa  151  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.52 
 
 		 316 aa  151  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.07 
 
 		 328 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.04 
 
 		 311 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  38.28 
 
 		 344 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 		 311 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 304 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  39.34 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  37.39 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.57 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  36.02 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  36.87 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  37.1 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  39.52 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.03 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  36.87 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  36.23 
 
 		 322 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.06 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  39.34 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.15 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  38.1 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 309 aa  148  5e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>