118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0165 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0165  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 726 aa  1474    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354505  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.15 
 
 		 715 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0263254  hitchhiker  0.000489248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3703  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 729 aa  200  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000380193  normal  0.301221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  20.45 
 
 		 790 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.24 
 
 		 730 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.19 
 
 		 720 aa  72  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3858  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 735 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.12 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 731 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 738 aa  65.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.98 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  21.65 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  21.67 
 
 		 772 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  21.35 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  21.35 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.83 
 
 		 333 aa  60.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 737 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.35 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.93 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  20.93 
 
 		 738 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 785 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.73 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 778 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 750 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 804 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  20.52 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.34 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  26.07 
 
 		 766 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.94 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  21.29 
 
 		 820 aa  58.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  21.15 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.45 
 
 		 753 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  21.94 
 
 		 741 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  21.43 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  35 
 
 		 309 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  21.25 
 
 		 739 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  31.62 
 
 		 740 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  21.25 
 
 		 739 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  21.17 
 
 		 727 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  30.77 
 
 		 740 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.57 
 
 		 311 aa  55.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  22.93 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  22.49 
 
 		 464 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.84 
 
 		 755 aa  55.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  23.03 
 
 		 815 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  19.2 
 
 		 734 aa  54.7  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  21.98 
 
 		 736 aa  54.3  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 735 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.06 
 
 		 742 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  30.12 
 
 		 743 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.85 
 
 		 726 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.29 
 
 		 463 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.35 
 
 		 741 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1370  hypothetical protein  23.22 
 
 		 751 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.250473  normal  0.334158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.26 
 
 		 740 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  19.41 
 
 		 806 aa  52  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  23.4 
 
 		 521 aa  52  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  21.73 
 
 		 527 aa  51.6  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1819  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like  21.71 
 
 		 764 aa  51.6  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  25.94 
 
 		 708 aa  51.6  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.58 
 
 		 732 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  33.33 
 
 		 304 aa  50.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.19 
 
 		 721 aa  50.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 		 301 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  27.54 
 
 		 225 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.48 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  21.88 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  19.93 
 
 		 741 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  19.57 
 
 		 788 aa  49.3  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.88 
 
 		 741 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  30.65 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.97 
 
 		 298 aa  49.3  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.54 
 
 		 294 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  21.54 
 
 		 798 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  28.44 
 
 		 257 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  19.96 
 
 		 736 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  27.54 
 
 		 225 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  19.46 
 
 		 737 aa  47.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  24.62 
 
 		 529 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  20.3 
 
 		 872 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 734 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 734 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.88 
 
 		 291 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  26.42 
 
 		 740 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  28.08 
 
 		 225 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 295 aa  46.6  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  25.23 
 
 		 780 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 		 295 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  22.81 
 
 		 751 aa  45.8  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 		 225 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  19.6 
 
 		 802 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.57 
 
 		 744 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.48 
 
 		 474 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  26.05 
 
 		 747 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  19.62 
 
 		 767 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 		 275 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  27.14 
 
 		 225 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  22.16 
 
 		 733 aa  45.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.46 
 
 		 741 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.77 
 
 		 720 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>