More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0312 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 301 aa  603  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  95.33 
 
 		 302 aa  587  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  93.36 
 
 		 301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  41.8 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  38.34 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  38.46 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0505  protein-export membrane protein SecF  38.56 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0158635  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  36.75 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  36.65 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.67 
 
 		 735 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3103  protein-export membrane protein SecF  35.29 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  38.08 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  36.14 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.88 
 
 		 752 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  37.86 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.66 
 
 		 761 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  30.79 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.45 
 
 		 750 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.73 
 
 		 755 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  31.92 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.09 
 
 		 750 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  34.81 
 
 		 302 aa  158  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  30 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.11 
 
 		 754 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.11 
 
 		 754 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.11 
 
 		 754 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.11 
 
 		 754 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.71 
 
 		 754 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.76 
 
 		 754 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.76 
 
 		 754 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.11 
 
 		 754 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.05 
 
 		 754 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  30.97 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  34.12 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  33.56 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  32.83 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  32.4 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  30.1 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  31.12 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  32.57 
 
 		 1001 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  28.85 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  31.21 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  30.69 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  32.06 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.14 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 		 759 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.04 
 
 		 989 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 		 759 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  32.32 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  32.79 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  32.11 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.43 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  31.77 
 
 		 304 aa  138  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 		 314 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  32.03 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  30.74 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  32.47 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  31.77 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  30.28 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.22 
 
 		 996 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  31.67 
 
 		 900 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.94 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  31.67 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  36.07 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  32.88 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  31.68 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  31.23 
 
 		 748 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.43 
 
 		 911 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  30.39 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  32.98 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.1 
 
 		 991 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  33.79 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  33.21 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  31.71 
 
 		 849 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  29.51 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  31.65 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  34.56 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  30.18 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  31.13 
 
 		 885 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  27.46 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.14 
 
 		 763 aa  132  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  28.92 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  29.14 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  29.14 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  29.14 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.07 
 
 		 977 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  29.14 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  32.64 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  29.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>