80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0781 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  100 
 
 		 699 aa  1436    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  38.68 
 
 		 713 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.756208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  34.68 
 
 		 729 aa  344  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 		 717 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  34.22 
 
 		 711 aa  323  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  29.19 
 
 		 703 aa  248  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  24.49 
 
 		 849 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 		 868 aa  97.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 856 aa  91.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  23.8 
 
 		 858 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  27.13 
 
 		 828 aa  85.5  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  25.63 
 
 		 863 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.63 
 
 		 863 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  22.51 
 
 		 869 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  22.37 
 
 		 874 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.46 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  34.09 
 
 		 852 aa  67  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.22 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.68 
 
 		 709 aa  60.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.27 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 		 807 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 1166 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.85 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.66 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.59 
 
 		 866 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.73 
 
 		 845 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.07 
 
 		 1032 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  21.56 
 
 		 402 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.73 
 
 		 799 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  21.52 
 
 		 723 aa  55.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.15 
 
 		 1318 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  26.53 
 
 		 1216 aa  54.7  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  19.62 
 
 		 901 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  27.21 
 
 		 1173 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  29.32 
 
 		 1165 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  22.39 
 
 		 1173 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.87 
 
 		 694 aa  53.9  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  23.96 
 
 		 1054 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.96 
 
 		 1054 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.14 
 
 		 1230 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.62 
 
 		 1053 aa  50.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.89 
 
 		 873 aa  50.8  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  27.27 
 
 		 1150 aa  50.8  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.06 
 
 		 1056 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.19 
 
 		 715 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.67 
 
 		 1203 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.26 
 
 		 1032 aa  49.3  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  29.89 
 
 		 882 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  22.08 
 
 		 729 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  24.12 
 
 		 824 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  24.93 
 
 		 869 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.56 
 
 		 832 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  27.37 
 
 		 1187 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  24.72 
 
 		 842 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  21.75 
 
 		 693 aa  48.1  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  25 
 
 		 758 aa  47.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  23.31 
 
 		 2157 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  28.26 
 
 		 1157 aa  47.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.81 
 
 		 1197 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.88 
 
 		 835 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  22.9 
 
 		 2189 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.66 
 
 		 817 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  22.16 
 
 		 2015 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1195  transcription-repair coupling factor  28.72 
 
 		 1157 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.865219  normal  0.466133 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  23.75 
 
 		 2152 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2220  transcription-repair coupling factor  26.74 
 
 		 1157 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.35 
 
 		 267 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  23.86 
 
 		 1173 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.74 
 
 		 830 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1176 aa  45.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1155 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  22.28 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.58 
 
 		 693 aa  45.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  28.09 
 
 		 1134 aa  45.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.68 
 
 		 1064 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.19 
 
 		 1205 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  21.84 
 
 		 799 aa  44.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  35.9 
 
 		 1770 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  26.37 
 
 		 1150 aa  44.3  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 1942 aa  44.3  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>