More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3376 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0853  extracellular solute-binding protein family 5  61.26 
 
 		 552 aa  691    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7150  putative oligopeptide ABC transporter (substrate binding protein)  60.53 
 
 		 557 aa  663    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.144912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0225  extracellular solute-binding protein  57.95 
 
 		 553 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1218  extracellular solute-binding protein  58.33 
 
 		 555 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0270957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 552 aa  1131    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0380  extracellular solute-binding protein  61.64 
 
 		 566 aa  687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3792  extracellular solute-binding protein  60.93 
 
 		 551 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.639455  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1932  extracellular solute-binding protein  64.22 
 
 		 586 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0832  4-phytase  59.63 
 
 		 553 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0405616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3381  4-phytase  58.21 
 
 		 560 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2065  extracellular solute-binding protein  61.3 
 
 		 605 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.414534  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  47.98 
 
 		 534 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0655  extracellular solute-binding protein  50.1 
 
 		 540 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  47.4 
 
 		 531 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 531 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  48.07 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1439  extracellular solute-binding protein family 5  46.91 
 
 		 540 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1277  extracellular solute-binding protein  47.1 
 
 		 598 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  44.38 
 
 		 532 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 		 533 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 531 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  42 
 
 		 539 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  39.82 
 
 		 539 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  40.26 
 
 		 533 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4619  4-phytase  41.87 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29 
 
 		 520 aa  183  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.03 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  176  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.82 
 
 		 531 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.63 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 		 527 aa  128  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.08 
 
 		 524 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 		 534 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 		 502 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 520 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.16 
 
 		 541 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.25 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.29 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0062  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.29 
 
 		 502 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 535 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.66 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  24.95 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.02 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.14 
 
 		 509 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 532 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 529 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 527 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 519 aa  117  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.2 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 528 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.61 
 
 		 528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  27.33 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.81 
 
 		 516 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 517 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  30.14 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.79 
 
 		 544 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 517 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 556 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 595 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.13 
 
 		 527 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 519 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  23.95 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.95 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  24.9 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  26.75 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  25.72 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.68 
 
 		 505 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>