More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0457 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 331 aa  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  60.8 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  55.96 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  27.08 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  28.74 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  22.7 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  40 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  22.59 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  40 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  33.67 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  38.78 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.69 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  38.78 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  41.86 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  37.14 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  41.86 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  38.1 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.36 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  19.6 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  29.06 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.24 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1419  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00505932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  29.55 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1822  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>