205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2962 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 360 aa  748    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  62.17 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  50.58 
 
 		 371 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  48.7 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  49.57 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  47.4 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  49.13 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  47.69 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  46.69 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  46.01 
 
 		 387 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  47.25 
 
 		 368 aa  335  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  45 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  43.45 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  47.8 
 
 		 380 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  46.53 
 
 		 388 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  46.78 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  44.76 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  43.23 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  45.35 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  45.95 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  45.95 
 
 		 387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  44.9 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  42.03 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  41.76 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  43.07 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  43.57 
 
 		 386 aa  293  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  41.55 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  42.24 
 
 		 353 aa  291  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  40.67 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  43.27 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  39.66 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  38.51 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  41.43 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  39.32 
 
 		 354 aa  268  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  41.16 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  40.64 
 
 		 350 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  38.46 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  38.96 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  38.46 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  40.97 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  38.84 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  38.17 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  39.03 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  36.91 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 397 aa  246  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  37.01 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  37.98 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  37.42 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  36.55 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 355 aa  235  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  33.82 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  36.61 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 		 354 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  36.71 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  34.71 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  35.28 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  35.21 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  35.07 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  34.99 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  34.6 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  37.54 
 
 		 626 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  35.22 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  37.54 
 
 		 626 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  37.54 
 
 		 626 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  36.23 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 		 625 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  32.65 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  34.8 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  32.75 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  34.9 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  35.87 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 362 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  32.07 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  33.74 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 377 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>