180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1590 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  100 
 
 
276 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  77.9 
 
 
277 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  73.19 
 
 
276 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  73.19 
 
 
278 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  55.8 
 
 
312 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  53.07 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  32.17 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  30.96 
 
 
283 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  34.29 
 
 
307 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  34.62 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.92 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  30.41 
 
 
285 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
291 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  33.6 
 
 
278 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
289 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  30.45 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  30.8 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  32.58 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  31.38 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  26.55 
 
 
287 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  30.92 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  28.63 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  29.96 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.02 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.28 
 
 
283 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
279 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  28.92 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
297 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  32.79 
 
 
331 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
298 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
298 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
294 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
295 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  29.48 
 
 
290 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
288 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  31.28 
 
 
298 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
286 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
288 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  31.09 
 
 
303 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  32.05 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
279 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.6 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
300 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  33.53 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  25.82 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25.2 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
387 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25 
 
 
246 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.59 
 
 
351 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  23.32 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  30.87 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  31.54 
 
 
358 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
338 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
334 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  26 
 
 
353 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.03 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  30.87 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  23.39 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.84 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>