More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0359 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 410 aa  845    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  49.51 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  51.72 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  39.95 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  40.49 
 
 		 415 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  37.05 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  37.96 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 422 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 409 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  32.27 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 440 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 406 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  31.59 
 
 		 452 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 426 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.59 
 
 		 403 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.06 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.13 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  27.27 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.42 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.14 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.61 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.61 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.97 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.67 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.37 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.46 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.61 
 
 		 406 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 407 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 1302 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  24.04 
 
 		 654 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 433 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  24.16 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.09 
 
 		 378 aa  89.7  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>