More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2160 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  100 
 
 		 391 aa  791    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  50.39 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  52.39 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  41.05 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 		 560 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  39.44 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  38.95 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  38.76 
 
 		 428 aa  225  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  37.12 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  36.81 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.03 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.05 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  36.2 
 
 		 441 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  39.53 
 
 		 434 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  38.52 
 
 		 391 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  39.01 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  35.95 
 
 		 407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.42 
 
 		 371 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.41 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  40.18 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  37.86 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  38.52 
 
 		 430 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  37.12 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.93 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  36.75 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.46 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  37.78 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  34.96 
 
 		 425 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  37.22 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  40.11 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  36.83 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  36.18 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.18 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  34.59 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.13 
 
 		 424 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  35.98 
 
 		 385 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 		 383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  33.88 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  35.03 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  34.69 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  34.69 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  36.29 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.69 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  31.57 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  35.77 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  35.45 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.3 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  35.91 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.24 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  34.69 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  38.6 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  33.06 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.24 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  34.69 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  35.83 
 
 		 431 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.61 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  33.9 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  32.16 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  34.96 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.31 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  35.07 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  34.91 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  31.87 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.08 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  36.58 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  35.26 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  33.95 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.69 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  36.04 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  35.43 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  34.79 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.77 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  32.37 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  34.88 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  32.9 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  32.37 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  35.06 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  34.68 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>