82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3536 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  783    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
409 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  34.99 
 
 
396 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  32.55 
 
 
409 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
414 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
399 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
446 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  32.05 
 
 
420 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  36.86 
 
 
396 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
412 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 
430 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
448 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
417 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  28.03 
 
 
407 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
404 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
396 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
402 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
399 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
402 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  33.08 
 
 
393 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
417 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 
403 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  31.18 
 
 
408 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  35.43 
 
 
419 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  33.68 
 
 
401 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  33.68 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  34.79 
 
 
407 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  31.66 
 
 
405 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  30.87 
 
 
410 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  31.91 
 
 
406 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
409 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  31.55 
 
 
390 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
427 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.91 
 
 
403 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.42 
 
 
405 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  25.65 
 
 
481 aa  123  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30.19 
 
 
430 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  31.13 
 
 
398 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  26.9 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
414 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
404 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  31.69 
 
 
395 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  28.37 
 
 
402 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
424 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  28.37 
 
 
402 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
407 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.73 
 
 
397 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
413 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  23.52 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  27.07 
 
 
453 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.1 
 
 
404 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.38 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  29.83 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  26.46 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 
1019 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  24.17 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  28.33 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  25.38 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 
467 aa  57.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  27.8 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.14 
 
 
410 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  24.82 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.52 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
388 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  40.48 
 
 
387 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.19 
 
 
405 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>