More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0002 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 369 aa  719    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.96 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  37.4 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  36.22 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.34 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.33 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  33.24 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  33.6 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.69 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  34.78 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.73 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.27 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.89 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.26 
 
 		 380 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  31.91 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.1 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.1 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  34.1 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.59 
 
 		 385 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.38 
 
 		 388 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  30.5 
 
 		 378 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.02 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  27.84 
 
 		 366 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.77 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.56 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.47 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.25 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  32.63 
 
 		 382 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.56 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  31.58 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.85 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.16 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  32.45 
 
 		 374 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.14 
 
 		 372 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.5 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.13 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 378 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.25 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.59 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.14 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  30.95 
 
 		 393 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.38 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  30.95 
 
 		 393 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.38 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.73 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  30 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.54 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.45 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.72 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.95 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.9 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.42 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.56 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.64 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  27.25 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  31.83 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.81 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  31.37 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.31 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.18 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  31.94 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  30.75 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.53 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.63 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  30.93 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.22 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.3 
 
 		 397 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.37 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  31.3 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.02 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.51 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  33.25 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  31.37 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  33.69 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  30.77 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.89 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.03 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.29 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.03 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  32.23 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.33 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  27.03 
 
 		 379 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.03 
 
 		 379 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.76 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  31.64 
 
 		 371 aa  172  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.04 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.7 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>