More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2173 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2173  methylation  100 
 
 		 146 aa  293  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  49.65 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.22 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  38.56 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  39.29 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  38.57 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  38.57 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  38.3 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  39.84 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  39.44 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  35.97 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  41.79 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  49.65 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  36.02 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  37.97 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  29.93 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  42.06 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  33.79 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  70 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  44.57 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  46.67 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  35.77 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  37.5 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  50 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  35.1 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  49.28 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  38 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  55.74 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  52.46 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  63.46 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  33.78 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  53.62 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  45.07 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  57.38 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  34.48 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  35.57 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  32.56 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  28.83 
 
 		 438 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.24 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  42.7 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  71.11 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  75 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  41.94 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  31.79 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  43.66 
 
 		 180 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  30.86 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  39.62 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  50.7 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  37.5 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  28.83 
 
 		 446 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  38.71 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.83 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  53.33 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  39.51 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.86 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  50 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  59.26 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  64.81 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  42.53 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  42.53 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  42.53 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  58.82 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  45.95 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.43 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  42.53 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  56.6 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  47.54 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  65.22 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  38.46 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  50.85 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  38.64 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  35.26 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  50 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  50.85 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  50.85 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  50.85 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  62.26 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  52.63 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  67.5 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  42.67 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  58 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  50.85 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  50.85 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  60.78 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  66.67 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  69.23 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  54.84 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  34.59 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  68.89 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  31.29 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  62.96 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  59.57 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  55.93 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  51.92 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  57.89 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  54.9 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  57.45 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  65 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>