65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6987 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6987  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 514 aa  1058    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146113  hitchhiker  0.000256581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 294 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  27.19 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3409  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.180337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.08 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  23.68 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.7 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  33.88 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  34.68 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.47 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  24.57 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.64 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  32.67 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.76 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.33 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  25.45 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3259  hypothetical protein  27.68 
 
 		 2149 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  32.57 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.33 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  31.45 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.12 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  29.61 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.29 
 
 		 381 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  30.89 
 
 		 320 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  27.89 
 
 		 458 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  31.18 
 
 		 244 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 		 362 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  28.67 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  32.71 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  31.91 
 
 		 375 aa  51.2  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 375 aa  51.2  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  26.34 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  32.81 
 
 		 367 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.31 
 
 		 350 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.31 
 
 		 350 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  24.47 
 
 		 367 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  37.76 
 
 		 1918 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  31.64 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 		 630 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  24.3 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.04 
 
 		 365 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  27.32 
 
 		 1755 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.18 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  27.47 
 
 		 623 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  33.07 
 
 		 366 aa  47  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  41.56 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  34.71 
 
 		 1707 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  22.7 
 
 		 365 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  27.34 
 
 		 367 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  27.45 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  28.65 
 
 		 456 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  31.71 
 
 		 459 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  28.12 
 
 		 352 aa  44.3  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  29.41 
 
 		 314 aa  43.5  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  28.65 
 
 		 266 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  24.27 
 
 		 351 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>