92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6234 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  30.62 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  29.74 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  27.2 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  30.69 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  23.92 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  27.16 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  25.23 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 878 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1276 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.59 
 
 		 810 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 718 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 689 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 1737 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  27.67 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.83 
 
 		 661 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  28.24 
 
 		 569 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 589 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 573 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 3145 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 909 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 716 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.13 
 
 		 725 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 795 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 505 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.74 
 
 		 832 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 		 385 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 739 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 927 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 3172 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 		 743 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 3301 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 789 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 587 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.1 
 
 		 764 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 750 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 612 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  29.71 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 750 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 699 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.47 
 
 		 462 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 1252 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 762 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 1252 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1192 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 685 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 583 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 406 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.88 
 
 		 820 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  28.38 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 406 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.2 
 
 		 733 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1676 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  21.12 
 
 		 734 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2684  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.27 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1694 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.83 
 
 		 594 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.79 
 
 		 1056 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1005 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 637 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.37 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  35.19 
 
 		 535 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  26.25 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 605 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 836 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.58 
 
 		 875 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  23.72 
 
 		 585 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 486 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 352 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.75 
 
 		 565 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 562 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  23.96 
 
 		 503 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 		 1213 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 681 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 373 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 265 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  34.55 
 
 		 955 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.29 
 
 		 715 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>