278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3993 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  65.24 
 
 		 236 aa  332  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  57.33 
 
 		 237 aa  285  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  57.21 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  55.9 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 		 229 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  48.36 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  44.75 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  44.75 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  41.55 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  36.06 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  40.19 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  37.33 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  35.55 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 251 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  36.74 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 662 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  36.06 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  36.92 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  36.82 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 		 320 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  33.79 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.96 
 
 		 303 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  33.02 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  31.56 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  37.04 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  33.5 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.1 
 
 		 137 aa  99  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>