More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3481 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 117 aa  240  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  48.04 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  43.24 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  44.12 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40.22 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  36.61 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  36.84 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  35.71 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  36.96 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  36.96 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  35.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  35.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  35.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  35.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  35.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  35.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  32.14 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  35.87 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  38.55 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  35.63 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  34.94 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.76 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  32.67 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  35.63 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  32.56 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  34.48 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  31.13 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  35.23 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  34.74 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>