More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2965 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2958  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000611309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4330  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0359782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0938  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 293 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.210407  normal  0.519262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 297 aa  131  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6410  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2115  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3773  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.653114  normal  0.0103842 
 
 
-
 
NC_002950  PG0826  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1447  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4030  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  51.04 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1346  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 310 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  55.42 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2097  hypothetical protein  23.81 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2771  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 292 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  50.59 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  43.69 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 309 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 319 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  46.34 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0623  transcriptional regulator, AraC family  44.21 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378679  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  35.61 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0263  transcriptional regulator, AraC family  46.99 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5541  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  34.45 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  33.33 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  47.44 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4441  helix-turn-helix domain-containing protein  35.34 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>