211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2674 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 319 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  50.62 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  46.6 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  45.37 
 
 		 318 aa  298  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  50.76 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  49.44 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.06 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  34.32 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  32.21 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  31.14 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  30.37 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  28.46 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.13 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 297 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.13 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.98 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  27.48 
 
 		 637 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  26.64 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  24.77 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  32.76 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.73 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.9 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.7 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  22.58 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  23.21 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  25.43 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  24.44 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  25.96 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  22.31 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.2 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.87 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  25.71 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.31 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.85 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  24.03 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  23.27 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.05 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  22.43 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  20.87 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  27.62 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  24.1 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>