More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2498 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.46 
 
 		 1212 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  47.51 
 
 		 1167 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  48.43 
 
 		 1167 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  48.11 
 
 		 1167 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  48.47 
 
 		 1170 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  52.14 
 
 		 1160 aa  726    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  58.73 
 
 		 1172 aa  867    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  47.52 
 
 		 760 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  53.46 
 
 		 1168 aa  771    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  48.51 
 
 		 1160 aa  667    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  100 
 
 		 774 aa  1573    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  48.38 
 
 		 1170 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  58.39 
 
 		 1194 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  46.02 
 
 		 1172 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  47.82 
 
 		 906 aa  634  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  46.27 
 
 		 1169 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  46.2 
 
 		 1169 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  46.69 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  45.92 
 
 		 1170 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  39.45 
 
 		 1137 aa  445  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  40.1 
 
 		 1136 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  41.46 
 
 		 1131 aa  419  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  38.72 
 
 		 565 aa  360  8e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  50.28 
 
 		 829 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  38.03 
 
 		 964 aa  277  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.3 
 
 		 1129 aa  244  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.78 
 
 		 1116 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1144 aa  217  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 		 1145 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  28.93 
 
 		 1138 aa  207  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.77 
 
 		 835 aa  181  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.68 
 
 		 1147 aa  173  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  34.89 
 
 		 971 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  34.26 
 
 		 969 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.18 
 
 		 1062 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.19 
 
 		 988 aa  140  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  45.45 
 
 		 814 aa  132  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  42 
 
 		 1069 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  42 
 
 		 1069 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  35.97 
 
 		 969 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  45.18 
 
 		 972 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.8 
 
 		 1046 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  34.77 
 
 		 933 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  39.13 
 
 		 877 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  42.28 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  41.72 
 
 		 555 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  40.69 
 
 		 572 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.53 
 
 		 801 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  34.55 
 
 		 1037 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  35.04 
 
 		 966 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.2 
 
 		 962 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  37.5 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  32.64 
 
 		 937 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.39 
 
 		 805 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  36.96 
 
 		 560 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  36.96 
 
 		 560 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  36.96 
 
 		 560 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  36.96 
 
 		 560 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  36.96 
 
 		 560 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  41.61 
 
 		 941 aa  101  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  41.61 
 
 		 941 aa  101  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  36.96 
 
 		 560 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  36.96 
 
 		 560 aa  101  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  36.96 
 
 		 560 aa  101  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  36.96 
 
 		 560 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 		 560 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  40.69 
 
 		 1201 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  33.2 
 
 		 1044 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  40.69 
 
 		 1201 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  37.97 
 
 		 1057 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  37.58 
 
 		 1177 aa  99.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  39.58 
 
 		 1095 aa  98.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  26.11 
 
 		 1065 aa  97.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  26.11 
 
 		 1065 aa  97.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  36.08 
 
 		 1099 aa  97.4  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  39.04 
 
 		 1043 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  41.83 
 
 		 724 aa  96.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  33.83 
 
 		 467 aa  96.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  37.14 
 
 		 925 aa  95.5  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  36.99 
 
 		 922 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.62 
 
 		 1028 aa  95.5  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  33.8 
 
 		 1013 aa  95.1  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  37.31 
 
 		 584 aa  94.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 669 aa  94.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  34.93 
 
 		 927 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  37.28 
 
 		 1038 aa  93.2  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.86 
 
 		 952 aa  93.2  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  40 
 
 		 872 aa  93.2  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  38.86 
 
 		 916 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.77 
 
 		 919 aa  92.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  38.86 
 
 		 915 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  39.22 
 
 		 1187 aa  92  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  38.86 
 
 		 915 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  38.1 
 
 		 1165 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  36.99 
 
 		 963 aa  91.3  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  42.31 
 
 		 921 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  29.6 
 
 		 929 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 		 1002 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  36.52 
 
 		 1051 aa  89.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  39.04 
 
 		 578 aa  89  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>