78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1972 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 131 aa  263  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  81.25 
 
 		 133 aa  216  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  56.59 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  55.81 
 
 		 139 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  55.38 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  53.54 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  51.64 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  44.17 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  51.43 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  41.43 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  41.77 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  40.22 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  41.56 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  38.33 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  37.84 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  32.91 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  35.8 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  31.62 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  31.13 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.37 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.97 
 
 		 271 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  31.86 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  31.15 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  38.04 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.1 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  30.34 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  42.42 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  30.6 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  30.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  25.4 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  27.56 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 858 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 858 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 858 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 858 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 858 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 858 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 858 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  48.08 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  29.03 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  32.48 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 241 aa  43.5  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  35.24 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  35.24 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1313  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  31.15 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  39.34 
 
 		 100 aa  42  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  48 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 113 aa  42  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 102 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  40.54 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  41.38 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  40.98 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  31.88 
 
 		 107 aa  40.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  35.71 
 
 		 1294 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  28.06 
 
 		 858 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  31.94 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  30.69 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  26.47 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  38.24 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  28.92 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3028  hypothetical protein  30.36 
 
 		 59 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0421336  normal  0.501717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>