More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1287 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
535 aa  1076    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  54.31 
 
 
547 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  48.71 
 
 
551 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  48.9 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  49.54 
 
 
549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  48.26 
 
 
555 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  46.32 
 
 
551 aa  495  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  38.87 
 
 
528 aa  335  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  41.73 
 
 
556 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 
567 aa  319  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  38.45 
 
 
575 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  35.33 
 
 
535 aa  309  9e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
560 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  39.47 
 
 
525 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 
507 aa  283  6.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 
526 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35.02 
 
 
552 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  33.46 
 
 
535 aa  266  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  33.62 
 
 
544 aa  261  3e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 
538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 
410 aa  233  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  41.64 
 
 
438 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.03 
 
 
443 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  38.48 
 
 
450 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.77 
 
 
426 aa  229  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  41.08 
 
 
434 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  41.85 
 
 
455 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 
544 aa  228  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 
444 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 
444 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.24 
 
 
443 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  40.57 
 
 
498 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.77 
 
 
455 aa  223  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
433 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 
423 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  41.9 
 
 
507 aa  220  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38.97 
 
 
482 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38.97 
 
 
482 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.38 
 
 
452 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 
444 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 
468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 
443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.02 
 
 
444 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.5 
 
 
428 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 
422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 
461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 
415 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 
438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  38.97 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 
478 aa  213  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 
478 aa  213  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.94 
 
 
439 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
439 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  40.32 
 
 
456 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.46 
 
 
432 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 
469 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
469 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  36.86 
 
 
457 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 
429 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 
478 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  38.15 
 
 
445 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 
482 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.71 
 
 
441 aa  210  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 
444 aa  210  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 
478 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.91 
 
 
441 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 
478 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 
478 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.14 
 
 
445 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.14 
 
 
445 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 
469 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 
478 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  38.11 
 
 
453 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 
437 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.1 
 
 
439 aa  207  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  36.58 
 
 
478 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 
397 aa  207  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 
428 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.1 
 
 
440 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 
437 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
459 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  40.13 
 
 
437 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.06 
 
 
445 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.06 
 
 
445 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 
480 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  37.14 
 
 
456 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  35.13 
 
 
434 aa  206  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.69 
 
 
457 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.3 
 
 
456 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  38.07 
 
 
484 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
436 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.74 
 
 
438 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  34.82 
 
 
442 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
436 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  37.38 
 
 
444 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  36.83 
 
 
456 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.74 
 
 
437 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>