257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1240 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  63.18 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  58.03 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  58.03 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  58.03 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 202 aa  221  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  52.02 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  58.03 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  53.89 
 
 		 202 aa  200  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  56.99 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 139 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  38.78 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  21.79 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  22.29 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.53 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  24.42 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  22.36 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  20.38 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  24.11 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  24.77 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  26.73 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  24.85 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  20.27 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  23.64 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  22.91 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  19.11 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  24 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  21.77 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  29.07 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  23.02 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  25.26 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  24.71 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  20.93 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  19.07 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  23.03 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  28.07 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  24.62 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  27.16 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  20.95 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  22.45 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3719  nucleoid occlusion protein  20.62 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>