181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0904 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  100 
 
 
456 aa  916    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  67.84 
 
 
450 aa  629  1e-179  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  67.54 
 
 
451 aa  627  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  66.45 
 
 
451 aa  623  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  64.04 
 
 
450 aa  598  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  56.92 
 
 
441 aa  490  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  56.31 
 
 
452 aa  476  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  58.69 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  52.95 
 
 
448 aa  449  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  43.76 
 
 
459 aa  354  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  41.56 
 
 
462 aa  352  8e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  43.23 
 
 
458 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  40.49 
 
 
484 aa  343  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  40.9 
 
 
455 aa  343  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  42.07 
 
 
485 aa  336  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  40.72 
 
 
468 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  41.36 
 
 
484 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  40.41 
 
 
463 aa  330  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  36.8 
 
 
451 aa  319  7.999999999999999e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.59 
 
 
701 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  58.14 
 
 
575 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.06 
 
 
781 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.28 
 
 
731 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.28 
 
 
731 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  58.14 
 
 
575 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.31 
 
 
731 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.28 
 
 
731 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.06 
 
 
723 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.06 
 
 
781 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.06 
 
 
784 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.04 
 
 
662 aa  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.98 
 
 
852 aa  47.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.98 
 
 
735 aa  47.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0031  cell division cycle protein 48-related protein  48.28 
 
 
448 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45 
 
 
800 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 
369 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.55 
 
 
760 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  46.15 
 
 
630 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.86 
 
 
617 aa  47  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1848  ATPase central domain-containing protein  36.26 
 
 
660 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.462699  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
614 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3280  ATPase central domain-containing protein  36.26 
 
 
660 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.940995  normal  0.620187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.67 
 
 
667 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  42.86 
 
 
930 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.56 
 
 
681 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
621 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0514  AAA ATPase central domain protein  39.73 
 
 
657 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33501  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.37 
 
 
732 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  40.54 
 
 
615 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.67 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  37.93 
 
 
658 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  40.98 
 
 
810 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  48 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.15 
 
 
350 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  57.89 
 
 
699 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03320  AAA+ family ATPase  29.57 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 
584 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2733  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.43 
 
 
671 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.622725  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  46.94 
 
 
639 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  58.33 
 
 
648 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.45 
 
 
673 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  52.08 
 
 
694 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.08 
 
 
633 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  59.46 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  52.08 
 
 
619 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  36.11 
 
 
810 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  57.89 
 
 
643 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 
644 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  59.46 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 
768 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
699 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.61 
 
 
769 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  43.75 
 
 
646 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.58 
 
 
656 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.15 
 
 
640 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.06 
 
 
738 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 
610 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.06 
 
 
737 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 
610 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.02 
 
 
355 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.15 
 
 
640 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.31 
 
 
697 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.06 
 
 
736 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
686 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  26.76 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.06 
 
 
737 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  43.4 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  32.26 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.13 
 
 
717 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.4 
 
 
709 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  46.15 
 
 
667 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 
697 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  43.4 
 
 
703 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 
697 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.53 
 
 
637 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  59.46 
 
 
584 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  62.16 
 
 
637 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  51.06 
 
 
599 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>