More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2886 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2886  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 252 aa  471  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197544  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5376  transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3808  LuxR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706178  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0350  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204823  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0940  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1891  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00164243  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2255  transcriptional regulator, LuxR family  42.14 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0543436  hitchhiker  0.000519578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4852  LuxR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2952  transcriptional regulator, LuxR family  37.83 
 
 		 207 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0281323  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10197  LuxR family two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2930  transcriptional regulator, LuxR family  34.2 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3574  transcriptional regulator, LuxR family  60.61 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4395  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1627  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0484719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.68 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  44.83 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.7 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 213 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.48 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1894  putative response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761861  normal  0.0769356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  32.66 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  47.89 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.61 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.87 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.82 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3573  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  37.89 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.75 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.05 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2039  two component LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.39 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.57 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  30.06 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1817  LuxR response regulator receiver  39.31 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0351  LuxR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147651  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  29.17 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  29.24 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  30.12 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 454 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.66 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.94 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>