More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2598 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2598  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  39.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 286 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>