More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2427 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 324 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  42.51 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  34.34 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  34 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  30.84 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.98 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  32.09 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  33.84 
 
 		 330 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.47 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1501  anti-FecI sigma factor, FecR  32.47 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  35.55 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  31.09 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.86 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.29 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.32 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  23.7 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.97 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  32.63 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  31.83 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  29.5 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  32.39 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.89 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.83 
 
 		 328 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.55 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  30.56 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  30.7 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  29.29 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  31.49 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.94 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  30.69 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.91 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.95 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.95 
 
 		 335 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  30.75 
 
 		 357 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.38 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  26.71 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  30.39 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.83 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  26.37 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.09 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  28.53 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  29.73 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  31.33 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.18 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  33.21 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  32.21 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.23 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  28.97 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  27.92 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  27.45 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  28.62 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  29.05 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  30.3 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  28.62 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  32.47 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.65 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  25.57 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  29.71 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1491  anti-FecI sigma factor, FecR  33.69 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  26.28 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  30.74 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  27.22 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  27.48 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.03 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  37.06 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  29.65 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  29.49 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  26.79 
 
 		 377 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  26.6 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  25.84 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  32.69 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.48 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  27.43 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.06 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  27.07 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  27.01 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  31.21 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  34.75 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  27.45 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  26.74 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  24.76 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  36.42 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30.16 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  25.47 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  28.48 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  25.42 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  30.55 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>