124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2266 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1175 aa  2373    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  32.22 
 
 		 1212 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  34.93 
 
 		 1190 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  27.86 
 
 		 1137 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.91 
 
 		 754 aa  110  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  29.25 
 
 		 1585 aa  109  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.25 
 
 		 1585 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.69 
 
 		 1099 aa  106  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.85 
 
 		 585 aa  105  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.29 
 
 		 622 aa  101  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  25.97 
 
 		 633 aa  96.3  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.14 
 
 		 636 aa  95.9  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  28.27 
 
 		 1620 aa  95.9  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  26.89 
 
 		 622 aa  95.5  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25 
 
 		 952 aa  93.6  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.37 
 
 		 464 aa  93.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.13 
 
 		 619 aa  92.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.93 
 
 		 633 aa  92.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25.39 
 
 		 633 aa  92  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  24.86 
 
 		 1284 aa  91.7  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  26.36 
 
 		 941 aa  91.3  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.2 
 
 		 636 aa  91.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.74 
 
 		 748 aa  89.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.38 
 
 		 609 aa  88.2  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.11 
 
 		 635 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.39 
 
 		 633 aa  87.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  23.5 
 
 		 650 aa  87  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.15 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25.21 
 
 		 1653 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  22.93 
 
 		 650 aa  84  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.37 
 
 		 388 aa  80.9  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1018 aa  81.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  32.84 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  28.02 
 
 		 1284 aa  79.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  30.59 
 
 		 1077 aa  79  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.17 
 
 		 611 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  22.01 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  22.1 
 
 		 655 aa  76.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  22.15 
 
 		 643 aa  75.9  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.71 
 
 		 797 aa  75.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.67 
 
 		 686 aa  75.5  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  31.49 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 		 2310 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.88 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.88 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.03 
 
 		 1090 aa  73.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  29.15 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.11 
 
 		 1038 aa  73.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  23.37 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  29.58 
 
 		 237 aa  71.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.2 
 
 		 715 aa  68.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.04 
 
 		 1189 aa  67.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.86 
 
 		 795 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.4 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.01 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.59 
 
 		 902 aa  64.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.94 
 
 		 1108 aa  64.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  24.43 
 
 		 1651 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.23 
 
 		 606 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.15 
 
 		 752 aa  62  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  28.16 
 
 		 2245 aa  60.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  26.64 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  31.55 
 
 		 1198 aa  58.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  23.98 
 
 		 1126 aa  58.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.36 
 
 		 1999 aa  57.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25 
 
 		 1116 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.82 
 
 		 315 aa  56.2  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  42.03 
 
 		 1408 aa  55.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  24.63 
 
 		 1185 aa  53.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  29.28 
 
 		 486 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1118 aa  53.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  20.69 
 
 		 769 aa  53.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  26.7 
 
 		 268 aa  53.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1126 aa  52.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  22.68 
 
 		 1255 aa  52.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.52 
 
 		 1324 aa  52.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  26.91 
 
 		 297 aa  52.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.19 
 
 		 1082 aa  52.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  22.17 
 
 		 759 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  22.41 
 
 		 759 aa  52  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1121 aa  52  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  22.41 
 
 		 769 aa  52  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  22.41 
 
 		 759 aa  51.6  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2944  serine/threonine kinase protein  33.61 
 
 		 762 aa  51.6  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  22.41 
 
 		 759 aa  51.6  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  22.41 
 
 		 759 aa  51.6  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  25.34 
 
 		 1622 aa  50.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.13 
 
 		 934 aa  50.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.43 
 
 		 914 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  21.72 
 
 		 759 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  21.72 
 
 		 759 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  21.72 
 
 		 759 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  30.5 
 
 		 521 aa  49.7  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.58 
 
 		 1111 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  30.23 
 
 		 488 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  21.72 
 
 		 759 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  26.29 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  42.86 
 
 		 1428 aa  48.5  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  34.69 
 
 		 1270 aa  48.5  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.02 
 
 		 901 aa  48.5  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>