More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3410 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3410  ABC transporter related  100 
 
 
275 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0325873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.57 
 
 
291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  52.19 
 
 
282 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.27 
 
 
265 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50 
 
 
278 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.77 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  43.98 
 
 
263 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  41.22 
 
 
272 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  42.38 
 
 
275 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  42.46 
 
 
255 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  43.03 
 
 
262 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  48.75 
 
 
246 aa  205  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 
261 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  43.15 
 
 
333 aa  205  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  41.08 
 
 
263 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  48.19 
 
 
257 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  51.72 
 
 
244 aa  202  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  40.3 
 
 
278 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  42.13 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  48.82 
 
 
266 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  51.5 
 
 
244 aa  199  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  43.53 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  41.91 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  46.83 
 
 
263 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  41.49 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  42 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  43.4 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  44.62 
 
 
289 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  47.22 
 
 
257 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
268 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  43.14 
 
 
276 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  51.72 
 
 
244 aa  193  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  48.71 
 
 
244 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.29 
 
 
271 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 
281 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  44.76 
 
 
284 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  45.21 
 
 
283 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  44.76 
 
 
284 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.69 
 
 
259 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  44 
 
 
252 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  45.99 
 
 
249 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
267 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.29 
 
 
271 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  48.72 
 
 
271 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  46.03 
 
 
258 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.35 
 
 
264 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 
271 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  45.61 
 
 
259 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  42.69 
 
 
273 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  39.6 
 
 
265 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.3 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  44.71 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  42.86 
 
 
257 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.25 
 
 
259 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.93 
 
 
260 aa  188  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.57 
 
 
263 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  45.38 
 
 
253 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  45.38 
 
 
253 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.05 
 
 
293 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  42 
 
 
278 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.05 
 
 
293 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.5 
 
 
270 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.65 
 
 
257 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.74 
 
 
287 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.68 
 
 
252 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.57 
 
 
284 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
257 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  43.75 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  42.8 
 
 
276 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.14 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.63 
 
 
439 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.68 
 
 
252 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.68 
 
 
252 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.93 
 
 
272 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  44.4 
 
 
259 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  46.38 
 
 
267 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.16 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  43.75 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.06 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.24 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  49.54 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.67 
 
 
251 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.2 
 
 
271 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  48.62 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.46 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  39.18 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  41.83 
 
 
259 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
267 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.2 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  40.35 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  43.91 
 
 
436 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  40.94 
 
 
254 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  40.07 
 
 
271 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  40.16 
 
 
263 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 
272 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  44.66 
 
 
255 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>